Мудрая крыса мутант Сплинтер, которая является наставником Черепашек ниндзя постоянно их тренирует, чтобы они находились в отличной форме и могли справляться с армией Шреддера. В игре "Лего черепашки ниндзя тренировка" вы побываете на такой тренировке и примете непосредственное участие в ней. Внизу экрана вам на время покажут клавиши на которые нужно нажать, по нажатию этих клавиш черепашки будут выполнять определенные удары. Если вы ошибетесь с клавишей, то Черепашка ниндзя выполнит неудачно удар и тренировка пойдет бестолку. Так что будьте внимательны и запоминайте комбинации.